La Agencia Central de PROSAR  (a cargo de la Directora de PROSAR, Prof. Dra. Beatriz Perazzi) tiene sede en el Departamento de Bioquímica Clínica, situado en el Hospital de Clínicas "José de San Martín" y depende de la Facultad de Farmacia y Bioquímica de la Universidad de Buenos Aires. Asimismo, el Departamento de Bioquímica Clínica pertenece al Instituto de Fisiopatología y Bioquímica Clínica (INFIBIOC) dirigido por la Prof. Dra. Marta Carballo y a la vez, la Directora de PROSAR, Prof. Dra. Beatriz Perazzi, es miembro del Consejo de INFIBIOC.

Asimismo PROSAR dispone de Agencias Regionales en todo el país, con un Director y un grupo de Bioquímicos en cada región.

De PROSAR participan diferentes  unidades académicas, instituciones del sector público y de laboratorios privados de todas las regiones sanitarias del país.
Se consolida la interacción con el resto de programas de la Fundación Bioquímica Argentina.